TAP PcG_MSI in Setaria italica

Full lineage¹: cellular organisms; Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Streptophytina; Embryophyta; Tracheophyta; Euphyllophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; Mesangiospermae; Liliopsida; Petrosaviidae; commelinids; Poales; Poaceae; PACMAD clade; Panicoideae; Panicodae; Paniceae; Cenchrinae; Setaria

Protein source: Phytozome v11


The colour code corresponds to the rules for the domains:

should be contained
should not be contained

Domain rules

WD40
CAF1C_H4-bd
FIE_clipped_for_HMM

(Domain names are clickable)



List of proteins (7)

hide all | show all
namename additionClick button to show/hide sequence: Download sequence?
Seita.2G291200.1.ppacid=32718249 transcript=Seita.2G291200.1 locus=Seita.2G291200 ID=Seita.2G291200.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.5G291000.1.ppacid=32681907 transcript=Seita.5G291000.1 locus=Seita.5G291000 ID=Seita.5G291000.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.7G311500.1.ppacid=32702863 transcript=Seita.7G311500.1 locus=Seita.7G311500 ID=Seita.7G311500.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.7G311900.1.ppacid=32704317 transcript=Seita.7G311900.1 locus=Seita.7G311900 ID=Seita.7G311900.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.8G003200.1.ppacid=32716016 transcript=Seita.8G003200.1 locus=Seita.8G003200 ID=Seita.8G003200.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.9G159200.1.ppacid=32691576 transcript=Seita.9G159200.1 locus=Seita.9G159200 ID=Seita.9G159200.1.v2.2 annot-version=v2.2
Seita.9G310000.1.ppacid=32690782 transcript=Seita.9G310000.1 locus=Seita.9G310000 ID=Seita.9G310000.1.v2.2 annot-version=v2.2
select all | unselect

A list of species letter codes included in the protein names can be found here (opens in new tab).

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¹ Information recieved using NCBI E-utilities and NCBI taxonomy database.
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